Amidaza (AMD)
Enzime:Sunt catalizatori biologici macromoleculari, majoritatea enzimelor sunt proteine
Amidaza:Catalizează hidroliza diferitelor amide alifatice și aromatice endogene și străine prin transferarea unei grupări acil în apă cu producerea de acizi liberi și amoniac.Acizii hidroxamici și alți acizi organici sunt utilizați pe scară largă ca medicamente, deoarece sunt constituenți ai factorilor de creștere, antibioticelor și inhibitorilor tumorali.Amidazele pot fi împărțite în acilaze de tip R și de tip S în funcție de stereoselectivitatea catalizatorului.
Pe lângă catalizarea hidrolizei amidelor, amidaza poate cataliza și reacțiile de transfer de acil în prezența unor co-substrate, cum ar fi hidroxilamina.
Amidaza cu diferite surse au specificitate de substrat diferită, unele dintre ele pot hidroliza doar amide aromatice, unele dintre ele pot hidroliza doar amide alifatice, iar unele hidroliza a- sau ω-amino-amide.Majoritatea aminelor au activitate catalitică bună doar pentru amidele aciclice sau aromatice simple, dar pentru aromaticele complexe, amidele heterociclice, în special amidele cu substituenți orto, sunt în general scăzute în activitate (doar câteva enzime prezintă efecte catalitice mai bune).
Mecanism catalitic:
Enzime | Codul produsului | Codul produsului |
Pulbere de enzime | ES-AMD-101~ ES-AMD-119 | un set de 19 amidaze, 50 mg fiecare 19 articole * 50 mg / articol, sau altă cantitate |
Kit de screening (SynKit) | ES-AMD-1900 | un set de 19 amidaze, 1 mg fiecare 19 articole * 1 mg / articol |
★ Specificitate mare de substrat.
★ Selectivitate chirală puternică.
★ Eficiență ridicată de conversie.
★ Mai puține produse secundare.
★ Condiții de reacție ușoare.
★ Ecologic.
➢ Screening-ul enzimatic ar trebui să fie efectuat pentru substraturi specifice datorită specificității substratului și să obțineți o enzimă care catalizează substratul țintă cu cel mai bun efect catalitic.
➢ Nu intrați niciodată în contact cu condiții extreme, cum ar fi: temperatură ridicată, pH ridicat/scăzut și solvent organic cu concentrație mare.
➢ În mod normal, sistemul de reacție ar trebui să includă substrat, soluție tampon (PH-ul optim de reacție al enzimei).Cosubstraturile, cum ar fi hidroxilamina, ar trebui să fie prezența în sistemul de reacție de transfer de acil.
➢ AMD trebuie adăugat ultimul în sistemul de reacție cu pH și temperatură optime de reacție.
➢ Toate tipurile de AMD au diverse condiții optime de reacție, astfel încât fiecare dintre ele ar trebui studiat în continuare individual.
Exemplul 1(1):
Activitatea de hidroliză la diferite substraturi amidice
Substratul | Activitate specifică μmols min-1mg-1 | Substratul | Activitate specifică μmols min-1mg-1 |
Acetamidă | 3.8 | ο-OH benzamidă | 1.4 |
Propionamidă | 3.9 | p-OH benzamidă | 1.2 |
Lactamidă | 12.8 | ο-NH2benzamidă | 1.0 |
Butiramidă | 11.9 | p-NH2benzamidă | 0,8 |
izobutiramidă | 26.2 | ο-Toluamidă | 0,3 |
Pentanamidă | 22.0 | p-Toluamidă | 8.1 |
Hexanamidă | 6.4 | Nicotinamida | 1.7 |
Ciclohexanamidă | 19.5 | Izonicotinamidă | 1.8 |
Acrilamidă | 10.2 | Picolinamidă | 2.1 |
Metacrilamidă | 3.5 | 3-fenilpropionamidă | 7.6 |
Prolinamidă | 3.4 | Indol-3-acetamidă | 1.9 |
Benzamidă | 6.8 |
Reacția a fost efectuată în soluție tampon de fosfat de sodiu 50 mM, pH 7,5, la 70 ℃.
Amide | Hidroxilamina | Hidrazina |
Acetamidă | 8.4 | 1.4 |
Propionamidă | 18.4 | 3.0 |
izobutiramidă | 25,0 | 22.7 |
Benzamidă | 9.2 | 6.1 |
Reacția a fost efectuată în soluție tampon de fosfat de sodiu 50 mM, pH 7,5, la 70 ℃.
Concentrația reactivului înrudit: amide, 100 mM (benzamidă, 10 mM);hidroxilamină şi hidrazină, 400 mM;enzimă 0,9 μM.
Exemplul 2(2):
Exemplul 3(3):
1. D'Abusco AS, Ammendola S., et al.Extremophiles, 2001, 5:183-192.
2. Guo FM, Wu JP, Yang LR și colab.Process Biochemistry, 2015, 50(8): 1400-1404.
3. Zheng RC, Jin JQ, Wu ZM și colab.Bioorganic Chemistry, 2017, disponibil online 7.